Fortune Arterial hikayesi erkek kahraman Kohei Hasekura etrafında dönüyor, o saygın insanların gittiği İngiliz tarzı orta ve lise öğrencilerini kapsayan 6 yıllık eğitim veren bir okula nakil oluyor. Bu okul Japonya anakarada kıyıya kapalı Tamatsu adası denilen bir ada üzerindedir ve oraya sadece botla gidilebilmektedir. Nakil olduktan hemen sonra o yan sınıfındaki gerçek türü vampir olan Sendo Erika adındaki bir öğrenciyi keşfeder.