Hikaye Gundam Build Fighters'ın bitiminden 7 yıl sonrasını anlatıyor. Hoshino Fumina Seiho Akademisinde yer alan Gunpla Savaş Kulübüne üyedir. Kulübün başkanı olarak, yaklaşan All-Japon Gunpla Savaş Şampiyonalarına katılmak için iki üyeye daha ihtiyacı vardır. Bir gün, Kenpo eğitimi için ustasıyla birlikte seyahat eden Kamiki Sekai adlı bir transfer öğrenciyle karşılaşır. İleriki günlerde genç bir Gunpla üreticisi olan Kousaka Yuuma'nın katılmasıyla, Gunpla Savaşı'na resmi olarak katılabilecektir. Bu sayede hikayemiz başlar.