Hikayemiz, insanlığın büyülü zırhlı böcekler yüzünden yeryüzünde yaşamaktan vazgeçip, havada süzülen şehirlerde yaşadığı bir zamanda geçiyor. Böylece büyücüler – büyülü güçleri olan böceklerle savaşan hava muharebe büyücüleri – ortaya çıkıyor. Kanata Age ise uçan büyücü akademisi şehri Misutogan’da yaşayan genç bir adam. O S128 özel takımının elit  as üyesi olup  ‘’ Kara Kılıç Ustası’’ unvanı ile mezun olmuş bir isim; yine de şimdilerde özel takım eğitmeni olarak hor görülüyor.  Bir gün arka arkaya on yenilgi almış acınası bir takım olan E601’e eğitmen olarak atanır. E601 kendilerine has bir-iki tuhaf hareketleri olan Misora Whitale, Lecty Eisenach, ve Rico Flamel isimli üç kızdan oluşuyor.